Hallo Peter,
eine Softwarelösung habe ich dafür selber noch nicht geschrieben, ich schätze aber dass es schon relativ aufwendig ist und für den Bootloader hat man nur begrenzt Platz. AES ist natürlich dann sinnvoll, wenn man verhindern möchte, dass die Übertragung beim Firmwareupdate mitgeloggt wird. Bevor du dich mit einer AES-Softwarelösung beschäftigst, schau dir mal den Xmega an, dieser hat nämlich ein Hardwaremodul dafür: AES Crypto Module und DES Instruction.
Grüße,
Dirk